Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD2Q9BTF0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms