Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTA3Q9BTC8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms