Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms