Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms