Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREX2Q9BQ50 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms