Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms