Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EYA3Q99504 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms