Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCF12Q99081 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF12Q99081 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms