Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
JMJD8Q96S16 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JMJD8Q96S16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms