Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CRAMP1Q96RY5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRAMP1Q96RY5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms