Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms