Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms