Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms