Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms