Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC34Q96HJ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms