Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms