Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms