Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms