Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOPBP1Q92547 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms