Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR2Q8WXI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms