Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC21AQ8NDW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC21AQ8NDW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms