Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC89Q8N998 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms