Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms