Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms