Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRX1Q86UT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms