Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms