Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms