Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP1BQ7LBR1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP1BQ7LBR1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms