Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms