Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms