Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms