Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms