Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP188Q5SRE5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms