Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRMS1LQ5PSV4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRMS1LQ5PSV4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms