Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HABP4Q5JVS0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HABP4Q5JVS0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms