Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC4Q5GLZ8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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