Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms