Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms