Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM71Q2Q1W2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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