Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNRD1Q16881 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNRD1Q16881 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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