Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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