Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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