Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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