Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASIC2Q16515 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASIC2Q16515 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms