Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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