Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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