Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGN3Q15651 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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