Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3A1Q15459 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A1Q15459 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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