Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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