Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHPRHQ149N8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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